Настоящая «вирусная сокровищница». Учёные нашли в планктоне Байкала «затерянный мир» ДНК-вирусов

Ученые Лимнологического института СО РАН (Иркутск) совместно с коллегами из НИИ эпидемиологии и микробиологии имени Пастера (Санкт-Петербург) впервые провели полный анализ сообщества кольцевых одноцепочечных ДНК-вирусов (CRESS) в планктонной фракции Байкала и обнаружили там целый «затерянный мир». Об этом сообщает Telegram-канал «Кругобайкальская наука».

CRESS-вирусы — одна из самых загадочных и разнообразных групп, заражающая всё, от растений и грибов до животных. Они играют ключевую роль в регуляции микробных сообществ, но их разнообразие в уникальных экосистемах, подобных Байкалу, оставалось «белым пятном», отмечается в сообщении.

Исследователи отфильтровали пробы воды с разных глубин и сезонов, чтобы поймать свободно плавающие вирусные частицы. Секвенирование выявило 47 CRESS-подобных геномов, 12 из которых — полные.

«Главный сюрприз: они оказались совершенно новыми. Максимальное сходство с уже известными в мировой базе данных последовательностями составило всего 77.2%, а идентичных совпадений не нашлось вовсе», — говорится в сообщении.

Филогенетический анализ показал, что белки Rep (ответственные за репликацию) байкальских вирусов образовали на древе жизни несколько обособленных кластеров. Часть из них сгруппировалась с малоизученными группами CRESS, другие — образовали собственные, уникальные «байкальские» кластеры, не входящие ни в одно известное вирусное семейство. Это прямое свидетельство длительной эволюции в изоляции, возможно, связанной с эндемичными хозяевами, отмечают исследователи.

«Они повсюду и они стабильны. Удивительно, но некоторые из этих вирусных геномов были обнаружены в пробах, взятых в разные годы, сезоны и на разных глубинах. Это говорит о том, что найденные вирусы — не случайные гости, а устойчивые и широко распространенные компоненты байкальской экосистемы», — делятся учёные.

Работа показывает, что древние изолированные водоемы, подобные Байкалу, являются сокровищницами еще не описанной вирусной жизни. Изучение этого «ископаемого» вирома позволяет понять глубинные законы вирусной эволюции и оценить истинное глобальное разнообразие микроскопического мира, большая часть которого все еще скрыта от нас.